Motoo Kimura a developpé cette théorie dans les années 60-70 pour expliquer le taux de diversité moléculaire considérable observé dans les populations, stipulant que la majorité des mutations étaient neutres ou presque neutres, sans toutefois écarter le rôle de la sélection naturelle.
Cette théorie a été quelque peu marginalisée dans les deux dernières décennies. Pourtant, c'est une théorie fondamentale qui est capable d'expliquer bien des changements évolutifs, et qui est à la base-même de la théorie des horloges moléculaires, que tout le monde utilise pour les reconstructions phylogénétiques.
Quarante ans après Kimura, et compte-tenu des développements spectaculaires de la génétique moléculaire et des évidences de sélection dans de nombreaux gènes, qu'en pense-t-on?